Este programa educativo se incorpora al programa institucional de tutorías de la Universidad Autónoma de Chiapas implementado por la Asociación Nacional de Universidad e Instituciones de Educación Superior (ANUIES), el cual se implementará de la siguiente manera:

El estudiante al ingresar al programa se le asignará un tutor de acuerdo al área de interés y de la línea de investigación que pretenda desarrollar dentro de su formación integral de posgrado.

Los alumnos de maestría podrán elegir libremente su tema de tesis o proyecto, con aval de su director de tesis. Los temas serán aprobados por el comité de investigación de posgrado; asimismo, se les inscribirá en el registro de tesis, en el desarrollo que llevará el departamento correspondiente, la tesis de grado deberá ser trabajos inéditos ubicados dentro del contexto de problemas relevantes para México y los proyectos deberán proponer ventajas competitivas en el sector productivo.

El director de tesis o proyecto es responsable de la supervisión de los avances del trabajo de investigación. Se propone que se reúna con el alumno, al menos, una vez a la semana para discutir los problemas que se presenten durante su desarrollo.